利用gyrB基因鑒定芽孢桿菌近緣種

作者：宗凱,盛旋,尤征合,呂俠影,孫娟娟,李云飛,張萍,余曉峰

摘要：本試驗從一批藥品中分離到11株疑似芽孢桿菌菌株,采用VITEK 2 systems compact生化鑒定系統和16S rDNA基因測序技術對其進行鑒定。結果顯示,除2株株菌(6號菌株鑒定為Microbacterium oleivorans,8號菌株鑒定為Moraxella osloensis),其他9株株菌均屬于芽孢桿菌屬(Bacillus)。但僅通過VITEK 2 systems compact鑒定和16S rDNA測序比對,均不能鑒定到種。因此,進一步選擇gyrB基因以及其blast分析結果構建系統發育樹,最終將1~5號菌株分別鑒定為B.oceanisediminis(99.08%),B.korlensis(90.71%),B.licheniformis(100%),B.marisflavi(97.26%),B.oceanisediminis(99.22%),9~12號菌株分別鑒定為B.megaterium(99.83%),B.boroniphilus(81.20%),B.jeotgali(90.70%),B.humi(81.39%)。實驗表明,利用16S rDNA與gyrB基因結合的方式能較好地將芽孢桿菌屬鑒定到種,是一種快速準確的芽孢桿菌種間鑒定方法,適合于藥品中分離菌株的種屬及近緣種的鑒定與區分。

發文機構：合肥海關技術中心

關鍵詞：芽孢桿菌16SrDNAgyrB基因鑒定Bacillus16S rDNAgyrB geneidentification

分類號： R44[醫藥衛生—診斷學]