iPath在生物海洋學中的應用

作者：舒王欣澤,孫軍

摘要：iPath是一個用于細胞路徑可視化和代謝途徑分析的免費網頁應用程序。iPath中的路徑是通過交互式瀏覽器查看的,它提供各種代謝途徑的直接導航,使人們能夠方便地訪問相關的化合物和酶。本文簡要介紹了最新的iPath3.0版本(http://pathways.embl.de)(基于4個KEGG的全局地圖,158個傳統的KEGG路徑圖,192個KEGG模板,以及其他代謝元素,組成了一個相互連接、手工繪制的代謝網絡),并舉例說明其在生物海洋學研究中的應用,以期引起國內學者對此工具的重視,促進其在生物海洋學研究中的應用。

發文機構：山東大學海洋研究院 天津科技大學印度洋生態系統研究中心

關鍵詞：iPath代謝途徑可視化KEGG路徑組學iPathmetabolic pathwaysvisualizationKEGG pathwayomics

分類號： Q819[生物學—生物工程]