利用高通量測序技術分析魚菜共生池塘的真菌多樣性和群落結構

作者：孟瑋,高攀,翟旭亮,胡建勇,楊天燕,李曉東,時春明

摘要：本文采集了位于新疆水生野生動物救護中心和烏魯木齊市米東區長山子鎮水源地養殖基地的魚菜共生池塘水樣及水培空心菜根系,基于Illumina HiSeq 2500高通量測序平臺對上述樣本的宏基因組ITS基因序列進行了測定和分析。在6份樣品(4份水體樣品、2份根系樣品)中,共檢測到78348條平均長度為256 bp的有效序列,這些真菌包括了6個門、25個綱和72個目。不同地點、不同樣品類型間的真菌微生物群落存在明顯差異,隸屬于子囊菌門(Ascomycota)錘舌菌綱(Leotiomycetes)白粉菌目(Erysiphales)白粉菌科(Erysiphaceae)的菌群為根系樣品所特有。烏魯木齊市米東區長山子鎮水源地養殖基地魚菜共生池塘的空心菜根系真菌的Alpha多樣性指數均最高,相應的對照池塘真菌多樣性組成則最低。Beta多樣性指數表明,烏魯木齊市米東區長山子鎮水源地養殖基地水樣和新疆水生野生動物救護中心空心菜根系真菌組成差異最大。從蔬菜長勢情況來看,烏魯木齊市米東區長山子鎮水源地養殖基地魚菜共生池塘明顯好于新疆水生野生動物救護中心,推測其原因為:前者水體中真菌種類和數量較多,特有菌類(如石黃衣、酵母菌)能夠改善水質、提供動植物生長繁殖的養分。

發文機構：浙江省海洋水產研究所 新疆維吾爾自治區水產科學研究所 重慶市水產技術推廣總站 烏魯木齊市百匯魚生漁業科技有限公司 浙江海洋大學水產學院

關鍵詞：魚菜共生新疆高通量測序真菌多樣性群落結構aquaponicsXinjianghigh-throughput sequencingfungus diversitycommunity structure

分類號： S964.3[農業科學—水產養殖]