口蝦蛄青島和舟山群體比較轉錄組研究

作者：張陽,婁方瑞,韓志強

摘要：隨著環境的變化,很多生物正經歷著其祖先從未經歷過的多重環境脅迫,為了研究不同地理群體對環境適應機制的差異性,采集了青島和舟山的口蝦蛄樣品進行轉錄組測序和分析,比較不同群體間轉錄組差異。2個群體的口蝦蛄經高通量測序后共獲得60223條Unigene,青島群體獲得121606條Unigene,舟山群體獲得157584條Unigene。2個群體口蝦蛄的差異表達基因為11391個。其中上調基因為6477個,下調基因為4914個。對差異表達基因進行GO功能分析和Pathway富集分析,得到61個不同的GO功能分類和257個代謝通路。其中包含2個GO功能顯著性富集分類和40個顯著性富集代謝通路。GO顯著富集表現在氧化還原酶活性和酰基Coa脫氫酶活性兩個生物功能,顯著性富集代謝通路主要表現在生理生化代謝途徑和信號傳導途徑。結果表明2個群體的口蝦蛄對環境的適應性存在較大差異,為全球環境變化風險評估提供基礎。

發文機構：浙江海洋大學水產學院 中國海洋大學水產學院

關鍵詞：口蝦蛄轉錄組基因注釋功能分類差異表達基因Oratosquilla oratoriatranscriptomegene annotationfunctional classificationdifferentially expressed genes

分類號： S931.1[農業科學—漁業資源][農業科學—水產科學]