多鱗鱚phds基因家族序列特征及其在低氧脅迫后表達變化

作者：林星樺,葉明慧,SEATAN Wanida,潘炎楊,陳芳圓,黃洋,朱春華,李廣麗,田昌緒

摘要：【目的】分析多鱗鱚(Sillago sihama)脯氨酸羥化酶(prolyl hydroxylases,Phds)基因家族序列特征,探討其在低氧響應過程的作用。[方法]通過硬骨魚類phds基因,在多鱗鱚轉錄組和基因組數據中比對篩選多鱗鱚phds基因。對多鱗鱚Phds蛋白序列進行結構域預測、系統進化和共線性分析等。采用實時熒光定量PCR檢測phds基因在低氧脅迫和復氧后的表達變化。【結果】在多鱗鱚基因組中共鑒定到三個phds基因,分別是phd1、phd2和phd3,開放閱讀框(ORF)全長分別為1635、1092、723 bp,分別編碼544、363、240個氨基酸。結構域預測表明,多鱗鱚Phd1、Phd2、Phd3蛋白均含有P4Hc保守結構域。系統進化分析發現,多鱗鱚Phds均與大黃魚(Larimichthys crocea)親緣關系最近。共線性分析表明,多鱗鱚phds與尼羅羅非魚(Oreochromis niloticus)上下游基因高度一致。phd1、phd2在低氧處理4 h鰓組織中mRNA表達顯著高于常氧組(P<0.05),但在心臟中無顯著性差異(P>0.05);phd3在低氧處理4 h的鰓組織中顯著低于常氧組(P<0.05),而在心臟中顯著高于常氧組(P<0.05)。【結論】多鱗鱚存在phd1、phd2和phd3基因,并在不同組織的低氧響應中起重要作用。

發文機構：廣東海洋大學水產學院//廣東省名特優魚類生殖調控與繁育工程技術研究中心//南方海洋科學與工程廣東省實驗室（湛江）

關鍵詞：多鱗鱚phds基因基因家族低氧脅迫基因表達Sillago sihamaprolyl hydroxylases genegene familyhypoxia stressgene expression

分類號： Q78[生物學—分子生物學]Q959.483.3[生物學—動物學]